当院で使用するCo2レーザーは波長の長い遠赤外線です。レーザー光が直進する性質を有しています。口腔内で使用する場合、レーザー光は口腔粘膜組織の水分で吸収されます。出力によって深達度が異なり、それを利用して軟組織の切開、歯周治療、根管治療に用いています。
高出力で照射するとその組織内で炭化層（200℃以上）、蒸化層（100℃）、血液凝固層（68~85℃）、タンパク変性層（44から65℃）、組織活性層（35℃）と層の分離が起きます。各種の層から細菌を殺菌したり、組織治癒の回復を促したりします。